GBLUP
GBLUP与传统BLUP的区别仅在于亲缘关系矩阵构建方式，因此很容易在原有平台上实施GBLUP，只需将A阵替换为G阵即可，极大地简化了基因组选择的实施过程。研究表明，GBLUP基因组选择准确性在多数性状上明显优于传统BLUP。
在GBLUP中，可以通过遗传标记来准确估计个体间的亲缘系数。由于使用了覆盖全基因组的遗传标记，能够捕获配子形成过程中的重组事件，基于遗传标记计算的亲缘系数能更准确地反映个体间真实的遗传距离，因此也被称为实现了的亲缘系数（Realized relationship）。目前最常用的利用遗传标记构建亲缘关系矩阵的方法是VanRaden提出的，即 
，其中，G为基于遗传标记的亲缘关系矩阵，M为校正后的基因型矩阵，其元素为
，分别代表三种基因型，p_j为标记j的小等位基因频率（Minor allele frequency，MAF）。
